Si ya tienes musgo te recomendaría que le hicieras un lavado completo, no basta mucho para matar una bomba o crear congestión en los radiadores, lo que pongas va a evitar que crezcan nuevas bacterias y organismos, pero no te va a sacar lo que ya tienes.
Para el uso de agua destilada es muy recomendable el uso de un pedazo de plata en el reservoir, que tiene baja oxidación y propiedades antibacteriales naturales, aunque puedes necesitar mas de una dependiendo del volumen de agua que tengas en el loop y se demora un tiempo en ser efectiva.
La otra alternativa es el uso de algún fluido para mezcla que ya incluya algún agente quimico además de ser solo color. EKWB hace uno super bueno y envían a chile relativamente barato, no sé donde venderán aquí directamente algo así, pero según EKWB el suyo tiene un uso recomendado de 12 meses.
Silver Coil: http://www.ebay.com/itm/Mayhems-Anti-Algae-Silver-Kill-Coil-for-Water-Cooling-99-999-Pure-Fine-Silver-/161756812456?hash=item25a97514a8:g:DuAAAOSwwE5WXcyW
Liquido EKWB: https://www.ekwb.com/shop/accessories/cooling-liquids-coolants