Las ram que pusiste no te sirven con tu pc actual, (ddr3 vs ddr4 que quieres comprar)
probablemente el cooler no te tapa completamente el slot y puedes buscar una opcion de una memoria de bajo perfil para que entre bien bajo el cooler.
un ssd de 250 esta mas que bien para el uso que se le da (SO y los juegos/programas mas usados)
dudo que puedas arreglar el pcie por el daño que tiene, lo mejor seria comprar otra mobo, pero si no te da problemas no es necesario que cambies, quizas buscar una placa de ese chipset no es tan caro, ya que estan descontinuadas.